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蘑菇、香菇、平菇等秋栽菇类的菌种，大多是在夏季进行生产和培养的。在高温条件下制种，往往污染率高，而成品率低。因此，为了保证秋菇适期种植和夏季菌种生产的质量，必须抓好灭菌、接种、培养措施。
1、抓好培养基灭菌：夏季温度高，配制的培养基要求新鲜、不霉变，拌好的原料要及时装入瓶、袋灭菌。制做瓶装菌种，要尽量减少棉塞和牛皮纸受潮现象。每次灭菌时，应用塑料袋封装少量棉花和牛皮纸带入一并灭菌。灭菌后，及时在接种箱内更换受潮的封口物。采用袋式生产菌种，每道生产环节都要轻装、轻拿、轻放，凡是刺破、挤破、胀坏的塑料袋，均应用医用胶布粘封好或采用双层袋套好。袋口可用橡皮圈或撕裂带代替棉塞和套环进行封扎。袋装基质可视装料量的多少，适当延长灭菌时间1-2小时，且排气要慢。
2、改进接种技术：因接种箱内采用酒精灯火焰接种，温度上升常达40-50℃，极易灼伤或烫死菌种。因此，接种要安排在早晚或夜间气温稍低的时间内进行。接种时，每次转瓶量比常规生产时适当减少，接种量要相对增大，瓶口上部的老化菌丝要挖除干净。
3、加强菌种培养管理：菌种培养场地要求清洁、无毒、无虫、凉爽、无阳光照射，相对湿度在60%以下。刚接好的菌种，必须等瓶袋外部和封口物干燥后，再进行堆叠。堆叠的高度和堆间的距离，要掌握不产生堆温、有利于通风、方便管理等原则。夏季制种染菌快，一般接种3天后应进行检查，一旦发现污染菌种就要及时清除。
